Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fam20bQ8VCS3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fam20bQ8VCS3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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Fam20bQ8VCS3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fam20bQ8VCS3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms