Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trpv3Q8K424 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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