Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitrm1Q8K411 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitrm1Q8K411 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitrm1Q8K411 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Pitrm1Q8K411 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pitrm1Q8K411 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms