Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2X3

Stn1, CST complex subunit STN1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stn1Q8K2X3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stn1Q8K2X3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stn1Q8K2X3 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms