Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Trappc12Q8K2L8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc12Q8K2L8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc12Q8K2L8 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc12Q8K2L8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc12Q8K2L8 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Trappc12Q8K2L8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms