Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brd3Q8K2F0 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brd3Q8K2F0 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Brd3Q8K2F0 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Brd3Q8K2F0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms