Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pnma3Q8JZW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Pnma3Q8JZW8 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Pnma3Q8JZW8 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pnma3Q8JZW8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pnma3Q8JZW8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pnma3Q8JZW8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pnma3Q8JZW8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Pnma3Q8JZW8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pnma3Q8JZW8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms