Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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Slc4a8Q8JZR6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc4a8Q8JZR6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms