Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.6 ms