Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Brf1Q8CFK2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Brf1Q8CFK2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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