Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc28aQ8CEI3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc28aQ8CEI3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc28aQ8CEI3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc28aQ8CEI3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc28aQ8CEI3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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