Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rdh13Q8CEE7 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rdh13Q8CEE7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms