Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Nup88Q8CEC0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms