Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG5

Crebrf, CREB3 regulatory factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrebrfQ8CDG5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CrebrfQ8CDG5 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CrebrfQ8CDG5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms