Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9U4

Gm9958, MCG147145, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9958Q8C9U4 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Gm9958Q8C9U4 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms