Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Atg4aQ8C9S8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atg4aQ8C9S8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Atg4aQ8C9S8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atg4aQ8C9S8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Atg4aQ8C9S8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms