Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Usp20Q8C6M1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Usp20Q8C6M1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Usp20Q8C6M1 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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