Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cnot2Q8C5L3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms