Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q2

Zhx3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, mousemouse

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Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zhx3Q8C0Q2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Zhx3Q8C0Q2 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Zhx3Q8C0Q2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms