Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm45793-201ENSMUST00000207900 1342 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm7648-201ENSMUST00000173036 1658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm6451-201ENSMUST00000121488 717 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm13131-201ENSMUST00000122228 321 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm16571-201ENSMUST00000159112 291 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Scgb2b1-201ENSMUST00000189372 338 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm43903-201ENSMUST00000205126 617 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 AC153974.1-202ENSMUST00000218700 678 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Vmn1r41-205ENSMUST00000227630 827 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 1700052I22Rik-201ENSMUST00000190431 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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Trim35Q8C006 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Mageb18-201ENSMUST00000088137 1571 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Trim35Q8C006 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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