Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ8

Fam53c, Protein FAM53C, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53cQ8BXQ8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Fam53cQ8BXQ8 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Fam53cQ8BXQ8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Fam53cQ8BXQ8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Fam53cQ8BXQ8 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Fam53cQ8BXQ8 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Fam53cQ8BXQ8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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