Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ube3dQ8BX13 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ube3dQ8BX13 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ube3dQ8BX13 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
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