Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp38Q8BW70 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Usp38Q8BW70 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Usp38Q8BW70 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms