Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pdcl3Q8BVF2 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pdcl3Q8BVF2 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms