Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Usp54Q8BL06 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Usp54Q8BL06 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms