Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Tspan9Q8BJU2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms