Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG0

Slc30a8, Zinc transporter 8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a8Q8BGG0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Slc30a8Q8BGG0 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Slc30a8Q8BGG0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Slc30a8Q8BGG0 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms