Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Smim19Q80ZU4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms