Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Negr1Q80Z24 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Negr1Q80Z24 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms