Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Zbed4Q80WQ9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Zbed4Q80WQ9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Zbed4Q80WQ9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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