Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pcsk9Q80W65 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pcsk9Q80W65 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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