Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
NischQ80TM9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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