Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf7ipQ7TT18 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms