Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Clec18aQ7TSQ1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Clec18aQ7TSQ1 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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