Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Gm45299-202ENSMUST00000211011 765 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ClmQ7TSN2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ClmQ7TSN2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms