Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms