Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc88cQ6VGS5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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