Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK0

Zbtb39, Zinc finger and BTB domain-containing 39, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb39Q6PDK0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Zbtb39Q6PDK0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms