Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zbtb40Q6PCS8 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zbtb40Q6PCS8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms