Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
BC061212Q6P8K3 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
BC061212Q6P8K3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms