Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrimpolQ6P1E7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrimpolQ6P1E7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms