Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Krt40Q6IFX3 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Krt40Q6IFX3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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