Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Arhgap20Q6IFT4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms