Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scaf8Q6DID3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scaf8Q6DID3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms