Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarca2Q6DIC0 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms