Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nop58Q6DFW4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nop58Q6DFW4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms