Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Q6DFW0 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms