Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pram1Q6BCL1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms