Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Pdzrn3Q69ZS0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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Pdzrn3Q69ZS0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pdzrn3Q69ZS0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzrn3Q69ZS0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Pdzrn3Q69ZS0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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