Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sh3rf1Q69ZI1 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Sh3rf1Q69ZI1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sh3rf1Q69ZI1 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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